“从数据到发现,更快速
世界领先的生物信息学软件平台 ”
01
—
概述
Geneious是一套功能强大的分子生物学和NGS分析工具软件包,业界领先的跨平台的生物信息学软件,支持Windows,Linux和Mac平台。
Geneious结合了所有主要的生物信息学分析工具。
✔序列比对和序列观看
✔Motif搜索和开放读码框(ORF)
✔进化树建设UPGMA,NJ bootstrapping和consensus trees
✔Contig assembly和色谱编辑
✔限制性内切酶分析
✔PCR引物设计
✔蛋白质结构的观看
✔整合数据库-集成检索与GenBank,PubMed,BLAST和UniProt
✔通过互联网协作和共享我爱线报网数据
✔生物信息教学-创建教程与直接联系的材料
✔公共API开发,由社区开发的生物信息学的免费插件
✔各种标准的生物信息学等应用工具ClustalW,MrBayes,EMBOSS,PAUP和Mauve
02
—
功能
解锁序列数据的价值
Sanger测序分析
✔通过简单的序列组装和对重叠群的轻松编辑提高您的映射准确性并减少您的分析时间
✔基因预测、基序、翻译和变异调用的自动注释
✔具有自动梯形拟合和峰值调用的基因型微卫星轨迹并生成等位基因表
下一代测序分析
✔在高度可定制的序列视图中显示的注释基因组和组件的精美可视化
✔强大的 SNP 变异分析,您可以选择算法或轻松查看提供的变异调用
✔无需任何统计编程语言 R 方面的专业我爱线报网知识即可进行简单的 RNA-Seq 表达分析
分子生物学
✔一步模拟多种分子克隆操作,包括限制、Gateway、Golden Gate 和 In-Fusion 克隆
✔使用优雅的引物设计工具设计和测试 PCR 和测序引物,并创建您自己的可搜索引物数据库
✔强大的 CRISPR 工具可让您快速轻松地查找位点、设计指导 RNA 并分析您的编辑结果
NGS 预处理、组装和映射
✔使用广泛的 NGS 预处理工具进行准确的下游分析,产生干净的序列数据
✔可靠的参考映射与独家映射算法产生卓越的结果
✔灵活的从头基因组组装可以处理来自所有测序机器的数据,并提供可用于比较和整理的比对工具
比对和系统发育
✔使用可信算法(包括 M我爱线报网AFFT 和 Clustal Omega)执行 DNA 或蛋白质的成对和多重比对
✔使用同行评审的算法(包括 RAxML 和 PAUP*)构建系统发育树,并调整可发布图形的显示设置
NCBI 和 BLAST
✔在 NCBI 的所有关键数据库中快速搜索文献、DNA 和蛋白质序列信息,或设置自动代理来为您搜索
✔对 NCBI 数据库中的序列进行 BLAST 搜索,结果直接返回到 Geneious Prime 或建立本地数据库并在本地进行 BLAST
✔将序列直接提交给 GenBank,包括基因组、特征、引物追踪等